ПЛР. SARS-CoV-2 (11 штамів) (коронавірус, COVID-19), якісне визначення штамів (назоорофарингеальний зішкріб)
Виявлення РНК коронавірусу COVID-19 методом ПЛР є основним для визначення активної фази захворювання, чи може людина бути джерелом зараження, при симптомах вірусних інфекцій, схожих з COVID-19, при виїзді та в'їзді до України з інших держав.
Нова тест-системи призначена для якісного виявлення РНК коронавируса SARS-CoV-2 генетичних ліній особливого епідеміологічного значення (VOC) шляхом виявлення мутацій в S-гені коронавіруса. Мова йде про штами Alfa (B.1.1.7), Beta (B.1.351), Gamma (P.1), Delta ( В.1.617.2) Omicron (B.1.1.529) та інші варіанти, викликаючі інтерес (VOI): Epsilon, Zeta, Eta, Theta, Lota, Kappa.
Показання для призначення:
1. При наявності симптомів захворювання COVID-19.
2. Для диференціальної діагностики захворювань, схожих з перебігом коронавірусної інфекції COVID-19.
3. При наявності контактів з людьми, у яких лабораторно підтверджено COVID-19.
4. При плановій госпіталізації та/або операції.
5. Декретованим контингентам населення.
6. Для підтвердження недавно перенесеної коронавірусної інфекції, в тому числі безсимптомного перебігу.
Досліджуваний матеріал: мазок із носоглотки та/чи ротоглотки.
Підготовка до дослідження: За 6 годин до взяття мазків з носа не закапувати краплі, не застосовувати спреї і не промивати ніс. Перед взяттям мазка, при наявності рясних виділень з носа, необхідно очистити носові ходи - сильним видихом видалити слиз з носа. За 60 хвилин до взяття мазків з та ротоглотки (зіву) не вживати їжу, не пити рідину, не чистити зуби, не полоскати рот/горло, не жувати жувальну гумку та не курити.
Метод дослідження: ЗТ-ПЛР (RT-PCR)
Обладнання: Bio-Rad CFX96. EASY PGX
Референтні значення:
1.РНК SARS-CoV-2 не виявлено.
2.РНК SARS-CoV-2 виявлено. У зразку біологічного матеріалу не виявлено мутацій SARS-CoV-2 методом RT-PCR, що характерно для дикого штаму SARS-CoV-2 .
3.Виявлено мутації HV69/70 deletion, N501Y, що характерно для Alfa штаму SARS-CoV-2 (Британський варіант).
4.Виявлено мутації K417N, E484K, N501Y, що характерне для Beta штаму SARS-CoV-2 (Південно-Африканській варіант).
5.Виявлено мутації K417T, E484K, N501Y, що характерно для Gamma штаму (Японсько-Бразильський варіант).
6.Виявлено мутації L452R, P681R, що характерно для Delta штаму, (Індійський варіант). 7.Виявлено мутації W152C, L452R, що характерно для Epsilon штаму, (варіант США(Каліфорнія).
8.Виявлено мутації E484K, що характерно для Zeta штаму, (Бразильський варіант).
9.Виявлено мутації HV69/70 deletion, E484K, що характерно для Eta штаму, (Варіант Великобританії та Нігерії).
10.Виявлено мутації N501Y, E484K, що характерно для Theta штаму, (Філіпінський варіант).
11.Виявлено мутації E484K, що характерно для Lota штаму, (варіант США). 12.Виявлено мутації L452R, P681R, що характерно для Kappa штаму, (Індійський варіант).
13. Виявлено: Omicron штам, варіант Південна Африка (мутації HV69/70 deletion, N501Y, P681R)