MyGene HRR + MMR
MyGene HRR + MMR — це розширена молекулярно-генетична панель на основі високопродуктивного секвенування (NGS), призначена для виявлення гермінальних (спадкових) мутацій у генах систем репарації ДНК: HRR (гомологічна рекомбінація) та MMR (репарація неспарених нуклеотидів).
Носійство мутацій у цих генах суттєво підвищує ризик розвитку різних видів онкологічних захворювань, зокрема раку грудної залози, яєчників, колоректального раку (синдром Лінча, поліпозні синдроми), раку підшлункової залози та передміхурової залози. Виявлення цих змін дозволяє оцінити індивідуальний генетичний ризик для пацієнта та його родичів, а також обрати персоналізовану стратегію профілактики та спостереження.
Перелік досліджуваних генів
BRCA1, BRCA2, CHEK2, BARD1, ATM, TP53, PALB2, PTEN, MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM, APC, ATM, BARD1, BLM, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK4, CDKN2A, CHEK2, EPCAM, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, PALB2, PMS2, PRSS1, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, SLX4, SMAD4, STK11, TP53, VHL.
Клінічні показання до проведення дослідження
Дослідження рекомендоване у таких випадках:
Персональний історія онкологічного захворювання:
- Рак молочної залози, яєчників, передміхурової або підшлункової залози у молодому віці (до 50 років).
- Колоректальний рак або рак тіла матки (ендометрія), виявлений у віці до 50 років.
- Наявність декількох первинних пухлин у одного пацієнта (наприклад, рак молочної залози та рак яєчників).
- Перстнеподібноклітинні чи високоагресивні форми пухлин.
Сімейний анамнез онкопатологій:
- Наявність двох і більше близьких родичів (I–II ступеня спорідненості) із пухлинами з спектра синдрому Лінча або HBOC (спадкового раку молочної залози/яєчників).
- Наявність відомого спадкового онкологічного синдрому або підтвердженої патогенної мутації у родича.
Матеріал і вимоги до зразка
| Тип біоматеріалу | Венозна цільна кров із консервантом K2EDTA або K3EDTA (пробірка з фіолетовою кришкою). |
| Об’єм матеріалу | 4–6 мл (мінімально необхідний об'єм — 2 мл). |
| Зберігання та транспортування | Зразки зберігаються та транспортуються при температурі +2…+8°C (із холодоелементом). Доставка в лабораторію має відбутися протягом 24–48 годин з моменту забору. Заморожування зразків цільної крові заборонено! |
Критерії відбракування зразка
- Згустки крові (гемоліз) або недостатній об'єм біоматеріалу в пробірці.
- Використання неналежного антикоагулянту (наприклад, гепарину, який інгібує ПЛР-реакцію).
- Перенесена алогенна трансплантація кісткового мозку або стовбурових клітин у минулому (у такому випадку аналіз гермінальних мутацій у крові буде відображати генотип донора).
- Переливання цільної крові або її компонентів (еритроцитарної маси) протягом останніх 4 тижнів перед забором.
Як замовити дослідження
| 1 | Консультація перед замовленням (рекомендовано) Скористайтесь послугою Медико-генетичного консультування — лікар-генетик CSD LAB допоможе підібрати оптимальний тест саме для Вашого клінічного випадку. |
| 2 | Заповнення направлення Заповніть форму направлення заздалегідь, зазначивши причину звернення. |
| 3 | Забір крові в CSD LAB Здати венозну кров у будь-якому зручному лабораторному офісі CSD LAB. Заповнюється направлення та згода на молекулярно-генетичне тестування. |
Результат і вплив на лікування
Панель MyGene HRR + MMR охоплює ключові гени, що відповідають за два критично важливі шляхи підтримки стабільності геному:
- Гени системи HRR (Homologous Recombination Repair)
Гени, мутації в яких порушують відновлення дволанцюгових розривів ДНК (BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2, PALB2, BARD1, BRIP1, NBN, RAD51C, RAD51D, CDK12, RAD50 та ін.).
Клінічна значимість: Асоційовані зі спадковим раком грудної залози та яєчників (HBOC), раком передміхурової та підшлункової залози.
- Гени системи MMR (Mismatch Repair)
Гени, що відповідають за виправлення помилок реплікації ДНК (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, а також EPCAM).
Клінічна значимість: Мутації у цих генах викликають Синдром Лінча (спадковий неполіпозний рак товстої кишки), який значно підвищує ризик колоректального раку, раку ендометрія, яєчників, шлунка, тонкої кишки та сечовивідних шляхів.
Методологія та контроль якості (QC)
| Технологічна платформа | Масивно-паралельне секвенування нового покоління (NGS) на платформі Illumina з використанням збагачення таргетних екзонних ділянок. |
| Аналітична чутливість | Детекція точкових замін (SNVs) та малих інсерцій/делецій (Indels) у кодуючих ділянках і ділянках екзон-інтронних з'єднань досліджуваних генів із точністю понад 99%. |
| Класифікація варіантів | Класифікація виявлених нуклеотидних замін згідно з керівництвом ACMG/AMP (5-рівнева система: патогенні, вірогідно патогенні, варіанти з невизначеним клінічним значенням [VUS], вірогідно доброякісні, доброякісні). |
Контроль якості
- Оцінка якості виділення ДНК: Обов'язкова флуориметрична оцінка концентрації та фрагментації геномної ДНК на етапі підготовки лабораторних бібліотек.
- Глибина покриття (Target Coverage): Суворий контроль середньої глибини читання локусів (зазвичай >100x для гермінальних панелей), що унеможливлює пропуск гетерозиготних мутацій.
- Подвійна валідація: інтерпретація та підпис висновку проводиться двома генетиками незалежно один від одного.
Суміжні тести та пакети
Для лікаря: корисні ресурси
- Настанови NCCN (National Comprehensive Cancer Network) з онкогенетики:
- NCCN Guidelines for Genetic/Familial High-Risk Assessment: Breast, Ovarian, and Pancreatic — рекомендації щодо гермінального тестування генів HRR та маршрутизації пацієнтів.
- NCCN Guidelines for Genetic/Familial High-Risk Assessment: Colorectal — критерії скринінгу на Синдром Лінча (гени MMR) та динамічного спостереження.
- Клінічні рекомендації ESMO (European Society for Medical Oncology) — алгоритми генетичного скринінгу та застосування таргетної терапії (PARP-інгібіторів) і імунотерапії на основі гермінального профілю пацієнта.
- Стандарти ACMG/AMP (American College of Medical Genetics and Genomics) — правила інтерпретації та класифікації варіантів послідовності ДНК у медичній генетиці.
МЕДИКО-ГЕНЕТИЧНА КОНСУЛЬТАЦІЯ