MyAction Universal Fusion
MyAction Universal Fusion — це інноваційне молекулярно-генетичне дослідження на основі технології секвенування наступного покоління (NGS) на платформі Illumina, спрямоване на глибокий аналіз РНК пухлини. Тест призначений для виявлення структурних перебудов генів (хромосомних транслокацій), які є потужними онкогенними драйверами у багатьох видах солідних пухлин у дорослих та дітей.
Аналіз РНК (на відміну від ДНК) дозволяє виявляти безпосередньо функціональні химерні транскрипти, незалежно від розміру інтронів та конкретних точок розриву в хромосомах. Виявлення таких злиттів дає змогу ідентифікувати пацієнтів, які отримають максимальну користь від найсучаснішої високоспецифічної таргетної терапії, зокрема від препаратів із так званою «пухлино-агностичною» дією (ефективних для будь-якого типу раку з відповідною мутацією).
Перелік досліджуваних генів
CSF1, NOTCH2, NTRK1, AKT3, FGR, MEAF6, MAST2, CAMTA1, PRKACB, MGEA5, FGFR2, EPC1, RET, MSMB, YAP1, PDGFD, PRDM10, MYOD1, ESRRA, RELA, CCND1, MAML2, ETV6, STAT6, GLI1, HMGA2, MDM2, FOXO1, AKT1, PRKD1, RAD51B, NUTM1, TCF12, MAP2K1, NTRK3, IGF1R, MKL2, PRKCB, FUS, PHKB, YWHAE, TAF15, ERBB2, GRB7, ETV4, MBTD1, USP6, PRKCA, SS18, MAST1, PRKACA, PKN1, DNAJB1, BRD4, JAK3, CRTC1, GPI, AKT2, NUMBL, AXL, CIC, PRKD2, CHMP2A, INSR, PAX8, ACVR2A, NFE2L2, ERBB4, PAX3, NCOA1, ALK, PRKD3, THADA, NCOA3, NFATC2, SS18L1, ERG, TMPRSS2, MN1, EWSR1, PDGFB, TFG, PPARG, RAF1, RAB7A, WWTR1, PIK3CA, ETV5, PRKCD, EGF, FGFR3, PDGFRA, KIT, TERT, FGF1, ARHGAP26, CSF1R, PDGFRB, VGLL2, ROS1, RSPO3, MYB, ESR1, PHF1, TFEB, MET, ETV1, BRAF, JAZF1, EGFR, RSPO2, MYC, NRG1, FGFR1, PLAG1, MYBL1, NCOA2, NR4A3, MUSK, BRD3, NOTCH1, NFIB, VCP, JAK2, CD274, NTRK2, ARHGAP6, BCOR, TFE3, CCNB3, AR, FOXO4, FOSB, FOS, PTEN, MDM4, GFI1B, CALCA, DDX3X, VGLL3, BCORL1, GLI2, SMARCB1, RB1, PTPN1, GFI1, TTYH1, MAP3K3, CHMP2B, CDK4, MITF, KMT2A, FN1, PTH, TSC2, PRDM6, GNAS, TTF1, MAP3K8, SRF, KRT20, SLC5A5, C11orf95, KRT7, PIP4K2A, RPS19, SMARCA4, MTG1, SERPINE1, NOTCH3
Клінічні показання до проведення дослідження
Молекулярне профілювання РНК пухлини за допомогою панелі MyAction Universal Fusion призначають у таких клінічних випадках:
- Скринінг на наявність транслокацій NTRK1/2/3 (для визначення показань до призначення високоефективної агностичної таргетної терапії інгібіторами TRK (ларотректиніб, ентректиніб))
- Неінформативність або суперечливі результати ІГХ/FISH: (коли рутинні методи (імуногістохімія чи флуоресцентна гібридизація in situ) не дають чіткої відповіді щодо наявності перебудов ALK, ROS1, RET чи NTRK)
- Діагностика рідкісних, агресивних пухлин та пухлин у дітей: (саркоми тканин та інші специфічні новоутворення дитячого віку часто керуються саме ф’южн-генами, виявлення яких критично як для точного діагнозу, так і для підбору лікування)
- Прогресування хвороби на поточній терапії (для пошуку вторинних перебудов чи рідкісних механізмів резистентності пухлини)
Матеріал і вимоги до зразка
| Тип біоматеріалу | Парафіновий блок (FFPE) з пухлинною тканиною + копія патогістологічного висновку |
| Вміст пухлинних клітин | Критично важлива вимога: частка пухлинних клітин у зразку тканини має становити не менше 20-30% (оптимально >40%) від загальної клітинної маси. Зону з найбільшою концентрацією пухлинних клітин перед екстракцією РНК розмічає патоморфолог. |
| Зберігання та транспортування | Температура +8…+25°C. Слід категорично уникати нагрівання зразків, оскільки РНК вкрай чутлива до температурної деградації. |
| Термін зберігання блоку | Не більше 5 років від моменту виготовлення |
Критерії відбракування зразка
Молекула РНК значно менш стабільна, ніж ДНК, і схильна до швидкого розпаду. Зразок може бути відхилений на етапі преаналітики CSD LAB через:
- Високий рівень фрагментації/деградації РНК: Якщо внаслідок тривалого перебування тканини без фіксатора (ішемія теплова/холодова) або перефіксації РНК розпалася на занадто короткі фрагменти, які неможливо секвенувати.
- Критично малий об’єм пухлинної тканини: Коли сумарна кількість РНК, виділена після мікродисекції біоптату, є недостатньою для підготовки РНК-бібліотек (RNA-Seq).
- Некоректна первинна фіксація матеріалу: Застосування небуференого формаліну, спиртових або кислотних розчинів руйнує РНК і унеможливлює виконання тесту.
- Масивні зони некрозу або виражений геморагічний компонент (переважна кількість еритроцитів), де пухлинні клітини відсутні чи зруйновані.
Як замовити дослідження
| 1 | Консультація перед замовленням (рекомендовано) Скористайтесь послугою Медико-генетичного консультування — лікар-генетик CSD LAB допоможе підібрати оптимальний тест саме для Вашого клінічного випадку. |
| 2 | Заповнення направлення Заповніть форму направлення заздалегідь (через електронний кабінет або за допомогою лікаря-куратора). Зазначте: діагноз і стадію, локалізацію первинної пухлини, попередні лінії терапії, очікуване клінічне рішення. |
| 3 | Передача матеріалу Парафінові блоки можна здати на дослідження в лабораторному офісі CSD LAB або в медичному закладі, який співпрацює з CSD LAB разом із копією патогістологічного висновку та заповненою формою направлення. |
Результат і вплив на лікування
Результат видається у вигляді структурованого звіту, а також рекомендації за потреби.
На основі молекулярного дослідження лікар отримує дані, які можуть вплинути на клінічні рішення щодо персоналізації лікування пацієнтів.
Методологія та контроль якості (QC)
| Технологія | Секвенування наступного покоління (NGS) на основі РНК (RNA-Seq) із застосуванням технології збагачення мішеней (Targeted RNA Capture) на платформах Illumina. |
| Біоінформатичний конвеєр | Спеціалізовані алгоритми для точного пошуку химерних послідовностей. |
| Перевага методу | Визначає не просто факт поломки в ДНК, а факт експресії функціонального химерного продукту, що безпосередньо запускає неконтрольований поділ клітин. |
Контроль якості
- Преаналітика: оцінка блоку патологом — визначення відсотку пухлинних клітин та некрозів.
- Контроль цілісності РНК: обов’язкова флуориметрична оцінка концентрації та капілярний аналіз фрагментації виділеної РНК перед початком пробопідготовки.
- Підготовка бібліотек: контроль якості бібліотек перед секвенуванням.
- Секвенування: якісний параметр Q-score ≥ 30 для ≥ 80% прочитань.
- Біоінформатичний аналіз: покриття цільових ділянок 99.5-100%, середня глибина прочитання ≥ 500x.
- ЛІС-моніторинг: кожен зразок маркується індивідуальним QR-кодом, його проходження по лабораторних етапах відстежується в Лабораторній Інформаційній Системі (ЛІС).
Суміжні тести та пакети
Для лікаря: корисні ресурси
- ESMO Clinical Practice Guidelines — офіційні рекомендації Європейського товариства медичної онкології щодо алгоритмів тестування та терапії пухлин із злиттями генів NTRK.
- NCCN Biomarkers Compendium — актуальні клінічні протоколи США, що регламентують обов’язкове РНК-NGS тестування для пацієнтів із прогресуючим раком легень без виявлених ДНК-драйверів.
- ClinicalTrials.gov — глобальний реєстр клінічних досліджень для пацієнтів із рідкісними та специфічними генними перебудовами (інгібітори RET, FGFR, NRG1 нового покоління).
ЗАМОВИТИ МЕДИКО-ГЕНЕТИЧНУ КОНСУЛЬТАЦІЮ