MyAction HRR (NGS-панель спадкових та соматичних мутацій в 32 генах для раку простати, яєчників, грудної та підшлункової залози, гістологічний матеріал, Illumina) \ N
Код аналізу:
M090
MyAction HRR (NGS-панель спадкових та соматичних мутацій в 32 генах для раку простати, яєчників, грудної та підшлункової залози, гістологічний матеріал, Illumina) \ N
Метод дослідження:
високопродуктивне секвенування наступного покоління (Next Generation Sequencing, NGS)
Термін виконання:
15 робочі дні
Досліджуваний біоматеріал:
гістологічний (парафінові блоки)
Ціна
від 22 360 грн
Замовити

MyAction HRR — це розширена онкологічна NGS-панель для виявлення соматичних та спадкових мутацій у 32 генах, що відповідають за репарацію ДНК шляхом гомологічної рекомбінації (Homologous Recombination Repair — HRR).

Визначення мутацій у генах HRR (зокрема BRCA1, BRCA2, ATM, PALB2, CHEK2) є вирішальним фактором для оцінки чутливості пухлини до PARP-інгібіторів (олапариб, талазопариб, рукапариб, нірапариб) та препаратів платини при раку яєчників, грудної залози, передміхурової та підшлункової залоз.

Досліджувані гени:

AR, ATM, ATR, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK12, CHEK1, CHEK2, ESR1, FANCA, FANCL, HDAC2, HOXB13, MRE11, NBN, PALB2, PPP2R2A, PTEN, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD54L, STK11, TP53, а також мутаційні «гарячі точки» (hot-spot регіони) генів: BRAF, ERBB2, KRAS, NRAS, PIK3CA.

  1. Клінічні показання до проведення дослідження

Панель MyAction HRR застосовується в онкологічній та медико-генетичній практиці:

  • Рак передміхурової залози (РПЗ) (метастатичний кастраційно-резистентний рак передміхурової залози (мКРРПЗ))
  • Рак грудної залози (РГЗ) (метастатичний або місцевопоширений РГЗ)
  • Рак підшлункової залози (аденокарцинома підшлункової залози)
  1. Матеріал і вимоги до зразка

Тип біоматеріалуFFPE-блок (парафіновий блок із біопсійним або операційним матеріалом пухлини) + контрольне скло H&E (забарвлене гематоксиліном і еозином). 
Вимоги до тканиниВміст пухлинних клітин у зразку — не менше 20% (оптимально >30%). Відсоток некрозів <30%/
Зберігання та транспортуванняFFPE-блоки зберігаються та транспортуються при температурі +15…+25°C. Захищати від перегріву та прямих сонячних променів.

Критерії відбракування зразка

  • Недостатня кількість або якість виділеної ДНК через виражену деградацію тканини при тривалій чи некоректній фіксації в формаліні (використовувати лише 10% нейтральний забуферений формалін, час фіксації: 12-48 годин).
  • Низький відсоток пухлинних клітин у зразку (<20%).
  • Декальциновані кісткові біоптати із застосуванням кислотних агентів (руйнують ДНК).
  • Аналітичне обмеження: дослідження соматичних мутацій у пухлині не завжди дозволяє чітко розмежувати соматичний (виключно в пухлині) та гермінальний (спадковий) статус мутації без паралельного аналізу ДНК крові.
  1. Як замовити дослідження

1

Консультація та вибір матеріалу

Скористайтесь послугою Медико-генетичного консультування — лікар-генетик CSD LAB допоможе підібрати оптимальний тест саме для Вашого клінічного випадку.

2

Оформлення замовлення

Заповнення направлення із зазначенням клінічного діагнозу, органа-першоджерела, анамнезу хімієтерапії та наданням патоморфологічного висновку.

3

Патоморфологічний контроль (Re-evaluation)

Патолог CSD LAB проводить мікроскопічний оціночний контроль скла H&E для підтвердження діагнозу та визначення ділянки з максимальним вмістом пухлинних клітин.

4

Отримання результату

Висновок містить перелік виявлених варіантів із інтерпретацією.

  1. Результат і вплив на лікування

Шлях гомологічної рекомбінації (HRR) — це ключовий механізм точного відновлення дволанцюгових розривів ДНК. Вимикання цього шляху внаслідок мутацій робить пухлину залежною від альтернативних (неточних) механізмів репарації та вразливою до терапії, що викликає додаткові розриви ДНК.

Інтерпретація та терапевтичний вплив

Предиктор чутливості до PARP-інгібіторів: мутації в генах HRR показанням для призначення таргетної терапії олапарибом, талазопарибом або існуючими комбінованими схемами відповідно до показань NCCN/ESMO.

  1. Методологія та контроль якості (QC)

Технологічна платформаВисокопродуктивне секвенування наступного покоління (Next Generation Sequencing, NGS)
Аналітична чутливістьДетекція соматичних мутацій (SNVs, Indels) з варіантною алельною частотою VAF від 5% у FFPE-тканині за умови достатньої якості ДНК.
Класифікація варіантівВикористання рекомендацій AMP/ASCO/CAP для соматичних варіантів (Tiers I–IV) та ACMG/AMP для потенційно гермінальних варіантів.

Контроль якості

  • Вхідний контроль FFPE-матеріалу: обов'язкова оцінка патологом відсотка пухлинних клітин та некрозів.
  • Оцінка деградації ДНК (DIN/QC score): кількісна та якісна флуориметрія виділеної ДНК перед підготовкою бібліотек.
  • Глибина покриття (Target Coverage): середня глибина секвенування для FFPE-тканини становить >500x, що дозволяє надійно виявляти низькочастотні соматичні мутації.
  • Подвійна валідація: інтерпретація та підпис висновку проводиться двома генетиками незалежно один від одного.
  1. Суміжні тести та пакети

  1. Для лікаря: корисні ресурси

  • Настанови NCCN (National Comprehensive Cancer Network): 

    - NCCN Guidelines for Prostate Cancer (рекомендація проведення тестування генів HRR для всіх пацієнтів із метастатичним РПЗ).

    - NCCN Guidelines for Ovarian Cancer / Breast Cancer / Pancreatic Adenocarcinoma.

  • Рекомендації ESMO (European Society for Medical Oncology): ESMO recommendations on microsatellite instability and HRD testing in oncology.
  • Бази даних клінічної значущості мутацій: OncoKB, CIViC, ClinVar.

Замовити Медико-генетичну консультацію

 

Код аналізу:
M090
MyAction HRR (NGS-панель спадкових та соматичних мутацій в 32 генах для раку простати, яєчників, грудної та підшлункової залози, гістологічний матеріал, Illumina) \ N
Термін виконання:
15 робочі дні
Ціна
від 22 360 грн
Замовити