MyAction Myeloid basic
MyAction Myeloid basic — це спеціалізована онкогематологічна панель на основі секвенування наступного покоління (NGS). Дослідження призначене для комплексної діагностики, стратифікації ризиків та підбору таргетної терапії при широкому спектрі мієлоїдних новоутворень (гострі мієлоїдні лейкемії, мієлодиспластичні синдроми, мієлопроліферативні новоутворення тощо).
Завдяки аналізу 37 ключових генів, що найчастіше піддаються соматичним мутаціям при гематологічних захворюваннях, панель дозволяє одночасно оцінити драйверні мутації, маркери несприятливого або сприятливого прогнозу, а також виявити молекулярні мішені для застосування сучасних інгібіторів (FLT3, IDH1/2, JAK2 тощо).
Перелік досліджуваних генів
Аналіз мутацій ДНК (однонуклеотидні варіанти, варіації кількості копій, а також інсерції та делеції) у 37 генах (цільові ділянки генів: ABL1, ANKRD26, ASXL1, BCOR, BRAF, CALR, CBL, CEBPA, CSF3R, DDX41, DNMT3A, ETNK1, ETV6, EZH2, FLT3, GATA1, GATA2, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, PHF6, PTPN11, RUNX1, SETBP1, SF3B1, SRSF2, STAG2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR2; аналіз варіацій кількості копій (CNV) для генів: ASXL1, BCOR, CBL, ETV6, EZH2, FLT3, RUNX1, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR2) щодо критично важливих маркерів ГМЛ (AML), МПН (MPN) та МДС (MDS).
Клінічні показання до проведення дослідження
Панель MyAction Myeloid basic застосовується в онкогематологічній практиці у таких випадках:
- Первинна діагностика та диференціальна діагностика:
- Підозра на гостру мієлоїдну лейкемію (ГМЛ / AML).
- Мієлодиспластичний синдром (МДС / MDS) або МДС/МПН перехресні захворювання.
- Мієлопроліферативні новоутворення (МПН / MPN): хронічна мієлоїдна лейкемія, справжня поліцитемія, есенціальна тромбоцитемія, первинний мієлофіброз.
- Хронічна мієломоноцитарна лейкемія (ХММЛ / CMML).
- Нез'ясована персистуюча цитопенія (анемія, лейкопенія, тромбоцитопенія) або нез'ясований лейкоцитоз/еозинофілія.
- Прогнозування та стратифікація ризику:
- Визначення молекулярного профілю за рекомендаціями ELN (European LeukemiaNet) та WHO для точного визначення групи ризику (сприятливий, проміжний, несприятливий).
- Вибір таргетної та персоніфікованої терапії:
- Виявлення мутацій у генах FLT3 (ITD/TKD), IDH1, IDH2 для призначення таргетних інгібіторів (мідостаурин, івозиденіб, еназиденіб тощо).
- Визначення мутацій JAK2, CALR, MPL при мієлопроліферативних патологіях для підбору інгібіторів JAK (наприклад, руксолітиніб)
- Моніторинг та оцінка рецидиву:
- Оцінка появи нових клональних мутацій або еволюції клону при прогресуванні чи рецидиві захворювання.
Матеріал і вимоги до зразка
| Тип біоматеріалу | Аспірат кісткового мозку або цільна венозна кров із антикоагулянтом K2EDTA або K3EDTA (пробірка з фіолетовою кришкою). Примітка: Аспірат кісткового мозку є пріоритетним біоматеріалом при ГМЛ та МДС. |
| Об’єм матеріалу | 2-4 мл кісткового мозку або 4-6 мл венозної крові. |
| Зберігання та транспортування | Зразки зберігаються та транспортуються при температурі +2…+8°C (із холодоелементом). Доставка в лабораторію має відбутися протягом 24–48 годин з моменту забору. Заморожування зразків цільної крові/кісткового мозку категорично заборонено! |
Критерії відбракування зразка
- Наявність згустків (гемоліз) або недостатній об'єм біоматеріалу.
- Використання неналежного антикоагулянту (наприклад, гепарину, який інгібує ПЛР-реакцію).
- Низький відсоток бластних клітин у зразку (нижче межі аналітичної чутливості тесту).
- Перенесена алогенна трансплантація кісткового мозку в минулому (аналіз відображатиме генотип донора, якщо не досліджується специфічно химеризм).
Як замовити дослідження
| 1 | Консультація перед замовленням (рекомендовано) Скористайтесь послугою Медико-генетичного консультування — лікар-генетик CSD LAB допоможе підібрати оптимальний тест саме для Вашого клінічного випадку. |
| 2 | Заповнення направлення Дослідження призначається лікарем-гематологом або онкологом. До зразка додається направлення з обов'язковим зазначенням попереднього клінічного діагнозу та даних загального аналізу крові/мієлограми. |
| 3 | Забір біоматеріалу Забір кісткового мозку здійснюється у спеціалізованому стаціонарі/маніпуляційній, забір венозної крові можливий у лабораторному офісі CSD LAB. |
Результат і вплив на лікування
Варіантна алельна частота (VAF) та її інтерпретація
Звіт містить параметр VAF (Variant Allele Frequency) — відсоток зчитувань, що містять мутацію:
- VAF = 50% або 100%: Може вказувати як на гермінальне (спадкове) походження мутації, так і на ранню соматичну драйверну мутацію з високою клональністю.
- VAF 5-30%: Характерно для соматичних субклональних мутацій, що виникають під час еволюції пухлинного клону.
- VAF < 2-5%: Виявляє малі субклони, що має критичне значення для оцінки резистентності до терапії.
Методологія та контроль якості (QC)
| Технологічна платформа | Секвенування наступного покоління (NGS) на платформі Illumina із мультиплексним збагаченням таргетних ділянок. |
| Аналітична чутливість | Детекція точкових замін (SNVs) та малих інсерцій/делецій (Indels) із порогом виявлення VAF від >5%, глибина прочитання >50. |
Контроль якості
- Оцінка якості виділення нуклеїнових кислот: Контроль кількості та фрагментації ДНК за допомогою флуориметрії перед підготовкою бібліотек.
- Глибина покриття (Target Coverage): Жорсткі рамки середньої глибини секвенування (зазвичай >500x-1000x для гематоонкологічних панелей), що забезпечує впевнене виявлення мінорних субклонів.
- Ортогональна перевірка: Визначення складних або критично важливих варіантів (наприклад, дуплікацій FLT3-ITD) за потреби підтверджується альтернативними молекулярними методами (фрагментний аналіз / ПЛР).
Суміжні тести та пакети
- Цитогенетичне дослідження при онкогематологічних захворюваннях (каріотипування)
- Діагностика гострої мієлобластної лейкемії (стандарт, FISH)
Для лікаря: корисні ресурси
- Настанови NCCN (National Comprehensive Cancer Network):
- NCCN Guidelines for Acute Myeloid Leukemia
- NCCN Guidelines for Myelodysplastic Syndromes
- NCCN Guidelines for Myeloproliferative Neoplasms
- ELN Recommendations for Diagnosis and Management of AML in Adults — використання NGS-панелей для визначення мутацій NPM1, FLT3, CEBPA, RUNX1, TP53, ASXL1 та створення підсумкового прогнозу при гострій мієлоїдній лейкемії.
- Класифікація ВООЗ (WHO 5th Edition) та ICC (International Consensus Classification) — сучасні критерії класифікації пухлин кровотворної та лімфоїдної тканин на основі молекулярно-генетичного профілю.