Контамінація при різних типах матеріалу
Як було сказано вище, контамінація зразка найчастіше відбувається під час забору біологічного матеріалу мікроорганізмами з сусідніх ділянок. Що може піти не так:
Сеча є одним із найбільш чутливих до контамінації матеріалів. Під час збору в неї легко потрапляє мікрофлора зі шкіри та слизових оболонок промежини. Це можуть бути коагулазонегативні стафілококи, ентерококи, лактобактерії або коринебактерії.
У лабораторному результаті така ситуація виглядає як наявність різних бактерій у невеликій кількості без чіткого домінування одного виду. Формально це може нагадувати інфекцію, але фактично нею не є.
При заборі урогенітальних мазків важлива точність локалізації. Через анатомічну близькість різних зон у зразок можуть потрапляти бактерії зі шкіри або сусідніх слизових.
Наприклад, можуть визначатися кишкові бактерії, стафілококи, стрептококи чи анаероби. У частині випадків це пов’язано з контамінацією під час забору, але інколи такі мікроорганізми можуть бути й клінічно значущими. Тому результат завжди оцінюють комплексно — з урахуванням кількості бактерій, типу матеріалу та клінічної картини.
Кал менш чутливий до контамінації, але й тут можливі помилки. Вони пов’язані з потраплянням сечі, води або контактом із поверхнями тіла під час збору.
Це може призводити до зміни бактеріального складу або появи мікроорганізмів, які не мають клінічного значення.
При дослідженні ран принципово важливо брати матеріал із глибини ураження, а не з поверхні. Шкіра майже завжди містить власну мікрофлору, яка легко потрапляє в зразок.
У таких випадках у результаті визначаються типові шкірні мікроорганізми – коагулазонегативні стафілококи, коринебактерії, мікрококи. Вони не обов’язково є причиною інфекції, але можуть створювати хибне уявлення про її природу.
Контамінація крові має особливе значення, оскільки навіть одиничний випадок може бути інтерпретований як серйозна системна інфекція.
Найчастіше вона виникає через недостатню антисептичну обробку шкіри перед забором. У результаті в зразок потрапляють бактерії шкіри – коагулазонегативні стафілококи, коринебактерії або Cutibacterium acnes. Це може виглядати як бактеріємія і призводити до необґрунтованого лікування. Проте також важливим є правильним вибір флакона та транспортування біологічного зразка. Оскільки спричиняти сепсис можуть як аеробні бактерії (потребують кисень для життєдіяльності), так і анаеробні (не потребують кисень, також він може бути токсичним), вони потребують різних середовищ та умов транспортування. Якщо не дотриматись цих вимог, то можна по дорозі до лабораторії втратити ці бактерії, що дасть хибнонегативний результат.
- Ротова порожнина і ротоглотка
Ці ділянки характеризуються високою різноманітністю мікрофлори. У нормі тут присутні стрептококи групи Viridans, непатогенні Neisseria, анаероби.
Тому будь-який зразок містить фонову флору. Завдання полягає в тому, щоб відрізнити її від збудника. При контамінації це стає значно складніше, оскільки межа між нормою і патологією стирається.
У цій зоні важливим є феномен носійства. Наприклад, Staphylococcus aureus може бути присутній у здорової людини без ознак захворювання.
При неправильній інтерпретації це може бути сприйнято як інфекція. Аналогічно, коагулазонегативні стафілококи або коринебактерії часто не мають клінічного значення, але з’являються в результаті.
При заборі матеріалу з вуха важливо враховувати ділянку забору. Якщо зразок отриманий із зовнішнього слухового проходу, у ньому можуть бути присутні представники нормальної шкірної флори — коагулазонегативні стафілококи, коринебактерії та інші умовно-патогенні мікроорганізми.
Тому поверхневий забір або порушення техніки можуть ускладнювати інтерпретацію результату, особливо якщо лабораторні дані не відповідають клінічній картині.